胞內(nei) RNA與(yu) 蛋白質結合情況的驗證: RIP

實驗意義(yi)

研究細胞內(nei) RNA與(yu) 蛋白質的結合情況，有助於(yu) 了解轉錄後調控網絡的動態過程，發現miRNA的調控靶點，可了解惡性腫瘤以及遺傳(chuan) 學疾病等整體(ti) 水平的RNA變化以及轉錄後調控網絡的變化，應用於(yu) 病理診斷及科學研究。

實驗原理及步驟

RNA結合蛋白免疫沉澱(RNA Binding Protein Immunoprecipitation, RIP)的基本原理是使用目標蛋白的抗體(ti) 捕獲內(nei) 源性的RNA-蛋白的複合物，然後通過免疫沉澱的方法把RNA-蛋白複合物一起分離下來，然後通過RT-PCR. RIP-Seq (高通量

測序)或RIP-Chip (microarray) 來鑒定結合的RNA序列。RIP流程如下圖

結果展示：

實驗周期及交付標準

1.實驗周期: 1-3個(ge) 月

2.交付標準: RIP鑒定結果報告、分析報告、實驗報告(試劑、耗材、實驗步驟)、

原始數據等

需確認的信息

1.目的基因與(yu) 蛋白信息。

2.是否提供抗體(ti)

3.樣本分組及分析要求

參考文獻

[1] Gagliardi M, Matarazzo M R. RIP: RNA Immunoprecipitation[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480:73.

[2] Meyer K，K?Ster T，Nolte C . et al. Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7[J] Genome Biology, 2017, 18(1):204.

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